中國科學院過程工程研究所前身是1958年成立的中國科學院化工冶金研究所。五十多年來，研究范圍逐步擴展到能源化工、生化工程、材料化工、資源/環境工程等領域，學科方向由“化工冶金”發展為“過程工程”。2001年更為現名。
      在國家“十三五”時期和中國科學院“創新2020”實施過程中，過程工程所進一步明確“引領過程工程科學前沿，支撐過程工業技術創新”的發展目標，瞄準國家戰略需求和世界科技前沿，針對當前制約過程工程跨越發展的突出問題，制定并實施“一三五”戰略規劃和科技布局：“一個定位”，即定位于過程工程的共性理論、關鍵技術及系統集成。面向過程工業轉型升級、產品結構調整和戰略新興產業發展的重大需求，發展過程工程科學前沿；“三項重大突破”，即介尺度理論與重大應用、礦產資源高效清潔利用、生物制藥過程關鍵技術與裝備；“五項重點培育方向”，即油氣高效轉化與綠色工程、功能材料化工及工程應用、生物質煉制過程強化與集成技術、綠色反應與分離工程、煤清潔轉化及綜合利用技術。圍繞重大突破和產出，探索適應過程工程跨越發展的體制機制，提出了創新科研組織模式和完善成果轉化鏈兩項重大改革舉措，形成符合過程工程學科發展規律的科研創新體系。
      這些年來，研(yan)(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)(suo)從(cong)無到(dao)有、從(cong)小到(dao)大(da)(da)，現(xian)擁有中關村本(ben)部(bu)(bu)、廊(lang)坊分部(bu)(bu)和(he)鄭州分所(suo)(suo)三個(ge)園區，中關村本(ben)部(bu)(bu)面向(xiang)基礎理(li)論側重(zhong)(zhong)(zhong)原(yuan)始(shi)創新，廊(lang)坊分部(bu)(bu)支(zhi)撐成果轉(zhuan)化(hua)進行模式驗證，鄭州分所(suo)(suo)推進產業應用(yong)進行示范工程，形成“一所(suo)(suo)兩翼”研(yan)(yan)(yan)(yan)發(fa)格局。研(yan)(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)(suo)現(xian)有四(si)個(ge)國(guo)家(jia)級研(yan)(yan)(yan)(yan)發(fa)平臺(tai)：生化(hua)工程國(guo)家(jia)重(zhong)(zhong)(zhong)點實(shi)驗室(shi)(shi)、多相復雜系統國(guo)家(jia)重(zhong)(zhong)(zhong)點實(shi)驗室(shi)(shi)、濕(shi)法冶金(jin)清(qing)潔生產技(ji)術(shu)國(guo)家(jia)工程實(shi)驗室(shi)(shi)、國(guo)家(jia)生化(hua)工程技(ji)術(shu)研(yan)(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)中心(xin)（北(bei)京）；六個(ge)省(sheng)部(bu)(bu)級研(yan)(yan)(yan)(yan)發(fa)平臺(tai)：中科(ke)(ke)院綠(lv)(lv)色過程與工程重(zhong)(zhong)(zhong)點實(shi)驗室(shi)(shi)、離(li)子液體清(qing)潔過程北(bei)京市重(zhong)(zhong)(zhong)點實(shi)驗室(shi)(shi)、納米材料(liao)北(bei)京市工程技(ji)術(shu)研(yan)(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)中心(xin)、過程污(wu)染控制(zhi)環境工程研(yan)(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)中心(xin)、生物質研(yan)(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)中心(xin)、循(xun)環經濟技(ji)術(shu)研(yan)(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)中心(xin)。研(yan)(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)(suo)以促進重(zhong)(zhong)(zhong)大(da)(da)產出、承擔(dan)重(zhong)(zhong)(zhong)大(da)(da)任務、培育人(ren)才隊伍(wu)為核(he)心(xin)，集中優勢力(li)量組(zu)建(jian)12個(ge)研(yan)(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)部(bu)(bu)，大(da)(da)幅提升承擔(dan)重(zhong)(zhong)(zhong)大(da)(da)科(ke)(ke)研(yan)(yan)(yan)(yan)任務的(de)能力(li)。研(yan)(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)(suo)科(ke)(ke)研(yan)(yan)(yan)(yan)儀器(qi)設(she)備(bei)投入(ru)逐年增加，通(tong)過購入(ru)、創新研(yan)(yan)(yan)(yan)制(zhi)等方(fang)式大(da)(da)力(li)進行科(ke)(ke)研(yan)(yan)(yan)(yan)裝備(bei)建(jian)設(she)，目前(qian)資產總(zong)值已達(da)9.3億元(yuan)，其中單價50萬元(yuan)以上先(xian)進設(she)備(bei)190臺(tai)，總(zong)值2.8億元(yuan)，120余臺(tai)先(xian)進通(tong)用(yong)儀器(qi)設(she)備(bei)實(shi)現(xian)了公用(yong)共享，有力(li)地支(zhi)撐了研(yan)(yan)(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所(suo)(suo)科(ke)(ke)研(yan)(yan)(yan)(yan)快速發(fa)展，并為上百家(jia)科(ke)(ke)研(yan)(yan)(yan)(yan)院所(suo)(suo)、大(da)(da)學、公司等單位提供了大(da)(da)量的(de)分析測試服務，得到(dao)用(yong)戶的(de)廣泛認可。主辦《過程工程學報(bao)》、《計算機與應用(yong)化(hua)學》、PARTICUOLOGY（《顆(ke)粒學報(bao)》）和(he) GREEN ENERGY & ENVIRONMENT（《綠(lv)(lv)色能源》）四(si)個(ge)學術(shu)期(qi)刊，一級學會中國(guo)顆(ke)粒學會掛靠我(wo)所(suo)(suo)。